Las colecciones «E» y «L», organizadas por número secuencial, se encuentran alojadas en nuestros depósitos interiores. La mayor parte de estos libros proceden del antiguo Instituto Jorge Juan de Matemáticas con aportaciones de las colecciones de destacados matemáticos españoles. También en el interior se conserva un pequeño fondo de libro antiguo. El contenido de estas colecciones pueden consultarse desde los catálogos del CSIC.